臨床主要用於治療冠心病、類風濕關節炎、肝纖維化、病毒性心肌炎、過敏性紫癜性腎炎等病癥。
1.冠心病：用復方丹參註射液穴位註射治療冠心病心絞痛患者126例，與二硝酸異山梨酯治療126例隨機對照，療程14日。以臨床表現和心電圖作為療效評價指標。結果：治療組有效率分別為88.9%和81.7%，兩組差異有統計學意義。(《時珍國醫國藥》2006年第1期)
2.類風濕關節炎：復方丹參註射液靜滴配合常規藥物治療活動期類風濕關節炎患者212例，與僅用常規藥物治療106例隨機對照，療程20日。以觸痛關節數、腫脹關節數、晨僵時間、雙手握力，患者疼痛程度評估、患者對疾病的總體評估、醫生對疾病的總體評估、HAQ、DAS28、ESR、CRP和RF共11項指標評定療效。結果：兩組患者治療後與同組治療前比較，各項指標均有明顯改善(P<0.05)。兩組患者的不良反應及安全性指標無顯著性差異(P>0.05)。(《遼寧中醫雜志》2010年第10期)
3.肝纖維化：本方靜滴治療肝纖維化患者216例，與西藥(能量合劑、支鏈氨基酸靜滴)治療198例隨機對照，療程1～2個月。以臨床表現及肝功能、肝纖維化指標為療效評價指標。結果：臨床表現、ALT、AST及肝纖維化指標治療組療效明顯於對照組(P0.05)。(《中華中醫藥學刊> 2011年第6期)
4.病毒性心肌炎：本方靜滴配常規綜合措施治療新生兒病毒性心肌炎患者30例，與僅用常規綜合措施治療30例隨機對照，以臨床癥狀、X線、心電圖及心肌酶等為療效評價指標。結果：觀察組治愈率、總有效率高於對照組，兩組比較有差異有統計學意義(P<0.01)；治療時間上，治療組明顯小於對照組，兩組比較有差異有統計學意義。(《中國婦幼保健》2009年第7期)
5.過敏性紫癜性腎炎：復方丹參註射液靜滴配合潑尼松口服治療治療過敏性紫癜性腎炎患者20例，與僅用醋酸潑尼松口服治療30例隨機對照，2周為1個療程，觀察2個療程。以血漿蛋白、尿蛋白、尿紅細胞差異為療效評價指標。結果：治療後兩組比較，血漿蛋白、尿蛋白、尿紅細胞差異均有統計學意義(P<0.05)。(《山東醫藥》2007年第31期)